O sequenciamento de DNA é uma ferramenta de biologia molecular para determinar a sequência (ordem) das bases nitrogenadas (A, T, C e G) num fragmento de DNA.
Sabendo essa ordem, é possível conhecer os genes, regiões reguladoras, RNAs, proteínas de um organismo, além de a sequência poder ser comparada com outras semelhantes, o que fornece dados importantes para o conhecimento científico.
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Atualmente, com os equipamentos e materiais adequados, sequenciar um trecho de DNA é relativamente fácil.
Quando falamos em sequenciamento de um genoma completo, a tarefa continua sendo complexa.
Para isso, é preciso quebrar o DNA do genoma em trechos menores e então juntar esses trechos em uma única longa fita consenso.
Existem alguns tipos de métodos para sequenciar o DNA, como por exemplo o Sequenciamento de Sanger e o Sequenciamento de Alto Rendimento (HTS, do inglês High-throughput sequencing).
Detalhes dessa técnica estarão em breve disponíveis em um post específico.
Essas técnicas são aplicadas no sequenciamento do exoma, do genoma, de RNA (transcriptoma), epigenoma entre outras.
Após os resultados, é necessário analisar as sequências para obter informações úteis sobre o DNA.
Essas análises são realizadas principalmente por técnicas de bioinformática.
Khan Academy. DNA Sequencing.
Illumina. DNA Sequencing - Understanding the genetic code.
Aplicações
O sequenciamento de DNA pode ser usado para determinar a sequência de genes individuais, regiões genéticas maiores, cromossomos inteiros e até mesmo genomas completos de qualquer organismo.Quando falamos em sequenciamento de um genoma completo, a tarefa continua sendo complexa.
Para isso, é preciso quebrar o DNA do genoma em trechos menores e então juntar esses trechos em uma única longa fita consenso.
Existem alguns tipos de métodos para sequenciar o DNA, como por exemplo o Sequenciamento de Sanger e o Sequenciamento de Alto Rendimento (HTS, do inglês High-throughput sequencing).
Sequenciamento de Sanger
Também chamado de método de terminação de cadeia, foi desenvolvido por Frederick Sanger e colaboradores em 1977, tornando-se rapidamente o método de escolha para sequenciar DNA.Detalhes dessa técnica estarão em breve disponíveis em um post específico.
Sequenciamento de Alto Rendimento
Dentre esse tipo de sequenciamento estão o sequenciamento de nova geração (NGS, do inglês next-generation sequencing) e o sequenciamento de terceira geração.Essas técnicas são aplicadas no sequenciamento do exoma, do genoma, de RNA (transcriptoma), epigenoma entre outras.
Análise dos resultados
Determinar a ordem em que os nucleotídeos estão localizados numa sequência de DNA é uma parte importante, mas não é tudo.Após os resultados, é necessário analisar as sequências para obter informações úteis sobre o DNA.
Essas análises são realizadas principalmente por técnicas de bioinformática.
Referências
Sigma Aldrich. Sanger Sequencing Steps and Method.Khan Academy. DNA Sequencing.
Illumina. DNA Sequencing - Understanding the genetic code.